ACIS, junto con el Sergas, los institutos de investigación biomédica y las fundaciones sanitarias, funciona como núcleo del ecosistema gallego de conocimiento en salud.
En este ecosistema, el papel de la Axencia de Coñecemento en Saúde es promover, dinamizar y dar soporte a las relaciones entre los centros de investigación, el tejido empresarial y los agentes de apoyo para garantizar la adecuada circulación del conocimiento y su puesta en valor de cara al paciente y al mercado.